商丘区位优越。商丘是中国重要的物资集散地和商贸中心，是河南省离出海口最近的地级市，是国家“一带一路”和中部崛起“两纵两横经济带”节点城市之一，是中原地区承接沿海地区产业转移的桥头堡。2015年6月，商丘市被列入《全国流通节点城市布局规划》66个区域流通节点城市之一。
商丘交通便利。2017年2月，国务院发布“十三五”现代综合交通运输体系发展规划，将商丘列为全国性综合交通枢纽。京九与陇海铁路、310与105国道、连霍与济广高速在商丘交会，构成了黄金“十字架”交通网络。沱浍河航运工程正在疏浚，商丘机场已列入“十三五”规划。郑徐高铁已建成通车，商合杭高铁河南段在商丘已经开工建设，京九高铁(商丘—雄安—北京段)也已列入“十三五”规划国家高铁建设一号工程。商丘未来将成为河南省仅次于郑州的高铁枢纽中心城市。
公路
2007年4月，商丘被中国交通运输部确定为国家公路运输枢纽。拥有经过商丘市区的G30高速、G35高速、105国道、310国道；四条国家主干道在市区交汇形成枢纽，9条高速公路以商丘环城高速圈为中心呈“米”字型向全市展开；30余条省道遍布全市各地
铁路
商丘铁路枢纽与郑州、徐州国家铁路主枢纽，济南、南京、杭州等区域铁路枢纽构成辐射状，是全国六大路网性枢纽之一，河南省第二大铁路枢纽，在全国铁路网中具有战略性的地位。
商丘火车站始建于1913年，日发送旅客2万余人，年客运量1000万人次，是河南省单个车站年发送旅客量仅次于郑州站的第二大火车站。商丘南站是京九铁路上的客运站。商丘北站为京九铁路的编组站。商丘西站为陇海铁路的货运站。
2017年2月10日下午，商丘市与郑州铁路局签订战略合作框架协议，双方就共同建设综合枢纽城市达成共识。根据协议，双方将加快推进商丘火车站南站房的改造、商丘动车运用所的建设、商丘物流基地的建设、商丘高铁拆迁安置、商合杭商丘新区站房建设、商丘市申报一类铁路口岸及公铁联运等项目。
航空
民国时期，在商丘宁陵县柳河镇始建商丘柳河机场，为国民空军机场，新中国成立后被废弃。
1968年，国务院、中央军委批复在商丘县观堂乡建设军用机场，称空军商丘机场。
2011年6月，国务院、中央军委正式批复立项商丘军民合用机场，在空军商丘机场的原址上新建的军民合用机场，建设成为河南省5大航空机场之一，成为国内重要的支线机场。商丘观堂机场位于商丘市梁园区观堂乡，东距商丘市中心约18公里，近期按4C支线机场标准建设，远期达到4D标准，总占地面积约5600亩，总投资约5.5亿元，主要发往北京、上海、广州、深圳等国内15座城市，远期可飞往国内全部城市和东南亚国家。
水运
沱浍河航运是商丘的主要航运通道，沱河、浍河是淮河的主要支流，沱河发源于梁园区的黄河故道，经虞城、夏邑，过白洋沟与浍河连接后汇入淮河，商丘段长约146.9公里。沱浍河航运以四级航道标准、五级断面实施；建有大青沟、黄口、张桥3座500吨级船闸，设计年通过能力420万吨；主要港口有新桥港、四里庙港、夏邑港3个港区，共建设13个300吨级泊位，设计年吞吐能力340万吨。涡河航运柘城港区为500吨级泊位。